Inteeltcoëfficient

Hoe wordt de inteelcoëfficient eigenlijk berekend in het spel?

Ik heb er een aantal nagerekend met de formule van Wright:


Fx is the inbreeding coefficient of the animal in question, Fa is the inbreeding coefficient of the common ancestor, n1 is the number of generations from the father to the common ancestor, and n2 is the number of generations from the mother to the common ancestor.

Ik kom op hele andere percentages uit. Neem het voorbeeld in de Wiki, daar kom ik uit op 12,5% in plaats van 20%.

Ook vind ik het vreemd dat als ik een inteeltmerrie kruis met een niet verwante SBL dat de inteelt bij het veulen nauwelijks minder is dan dat van de merrie (zie het veulen van deze merrie http://www.horsetycoon.nl/game/index.php?p=horse&id=60842). Je zou verwachten dat de inteelt van het veulen dan de helft is van die van zijn moeder. (De berekening van Wright voldoet niet in een situatie waarin de ouders geen gemeenschappelijke voorouders hebben, er komt dan namelijk 0 uit! maar mijn intuïtie zegt dat in dat geval de gemiddelde inteeltcoëfficient van de ouders genomen zou moeten worden)


Wie weet hoe het precies zit??

Naar mijn weten is het berekend zoals op deze website aangegeven:
http://www.schilduil.org/articles/index.php?article=20060623_Inteelt_berekenen.nl.html

Maar dat is dezelfde formule als die jij aanhaalt..

Even kijken of we wat over het hoofd zien

[edit]
heb er nu al hoofdpijn van gekregen

Hahaha Ik zit ook al met mijn hoofd in mijn handen en allemaal verfrommelde volgekrabbelde kladblaadjes om me heen aan mijn buro...

Edit: Ik voeg af en toe nog wat toe aan mijn bovenstaande verhaal...ik ga gewoon door met krabbelen...


Ik ben eruit! ik weet hoe in het spel de inteeltcoëfficient berekend wordt!
veel simpeler dan met de Wright formule...
De formule is eigenlijk deze:
Fx = 100* (1/2 * Ndubbel/Ntotaal)

Waarin Fx is inteeltpercentage, Ndubbel is het aantal dubbele namen in de (complete) stamboom (als één naam 4 keer voorkomt telt hij 4 keer mee etc.) en Ntotaal is het totaal aantal namen in de stamboom.

Als ik dat gebruik kloppen volgens mij de meeste inteeltcoefficienten!

uitkruisen met een SBL heeft dus weinig zin om het inteeltcoefficient te verlagen...je voegt daarmee maar 1 naam toe aan de stamboom. Beter is te kruisen met een andere volle stamboom (met niet al teveel dezelfde namen) als je de inteeltcoefficient wilt verlagen.


hmmm nu ben in toch niet meer zo zeker...deze is raar:
http://www.horsetycoon.nl/game/index.php?p=horse&id=74627
die komt boven de 50% uit en dat zou niet moeten kunnen... bij mij komt er 41,7 % uit (25 dubbel van de 30). Inteeltpercentages van boven de 50% zijn sowieso heel raar, want dat zou je normaalgesproken krijgen na zelfbevruchting. Broer x zus is 25%, vader x dochter ook.

Rekent hij bij die laatste soms ook nog de paarden mee die niet zichtbaar zijn?

Dat kan, maar op het profiel van het paard zijn maar 14 nemen te zien, de rest heeft ze denk ik al uitgezocht.

Ik had inderdaad alle voorouders meegerekend, maar het is heel raar dat deze boven de 50% uitkomt. Als namelijk alle voorouders dubbel in de stamboom zouden staan, dan komt er 50% uit mijn berekening...er kan nooit meer dan 50% uitkomen. (omdat de formule begint met 1/2* en de breuk die daarna komt is kleiner of gelijk aan 1)

Edit: Een paard met inteelt in de stamboom, maar waarvan de ouders niet aan elkaar verwant zijn zou eigenlijk een inteeltpercentage van 0 moeten krijgen (zoals er dan ook met de formule van Wright 0 uitkomt). Zo'n paard is namelijk ''uitgekruisd'' en niet ''ingeteeld''. Bij het uitkruisen worden de genenparen meer heterozygoot (verschillend). De nakomeling krijgt de ene van zijn moeder en de ander van zijn vader. Bij intelen wordt de genenset juist meer homozygoot (gaat meer op elkaar lijken). De genensets van de vader en de moeder lijken immers op elkaar doordat ze gemeenschappelijke voorouders hebben. De inteeltcoefficient van Wright is ook een maat voor de homozygotie van de genenparen (hoe hoger de inteeltcoefficient, deste meer homozygotie). Als je een ingeteeld paard kruist met een niet verwant paard krijg je juist veel heterozygotie....en dus geen inteelt! De genen van vader en moeter lijken namelijk niet opelkaar.


Wel is het zo dat mensen in het spel veel dubbele namen in de stamboom er lelijk vinden uitzien of dat ongewenst vinden. Daarom is er denk ik voor gekozen om ook inteelt bij de (voor)ouders mee te tellen. Feitelijk is dit onjuist.

Ik heb nog steeds geen antwoord op mijn vraag...hoe wordt nou de inteelt berekend in het spel?

Hij telt het totaal aantal paarden in de stamboom. Dus stel, je hebt dan 12 paarden. Als er inteelt is zijn er misschien maar 10 uniek omdat er 2 paarden, 2x voorkomen.

De formule:

100-(((#unieke_paarden#-1) / (#paarden#-1)) * 100)

De -1 omdat hij het paard zelf ook meetelt.